Namun, drama terjadi ketika Indonesia harus bertanding melawan Israel di babak playoff tersebut. PSSI sempat meminta agar pertandingan diadakan di tempat netral, tetapi permintaan tersebut ditolak oleh FIFA. Indonesia akhirnya memutuskan untuk mundur dari pertandingan tersebut setelah menerima perintah langsung dari Sukarno.
Indonesia juga menolak kehadiran atlet Israel pada Asian Games 1962 yang diadakan di Indonesia. Indonesia tidak memberikan visa kepada atlet Israel yang berkompetisi di Asia, sehingga harus membayar denda kepada IOC sebagai konsekuensi atas keputusan tersebut.
